Cryptosporidium-infecties bij de mens worden bijna altijd veroorzaakt door ofwel Cryptosporidium hominis ofwel door Cryptosporidium parvum. Zo’n infectie veroorzaakt een acute diarree die vaak gepaard gaat met darmkrampen. Cryptosporidium-infecties kunnen worden opgelopen via direct contact tussen mensen, tussen mens en dier, maar ook indirect door fecaal besmet drinkwater, oppervlaktewater en zwembadwater of via besmet voedsel. C. parvum-infecties worden geassocieerd met fysiek contact met boerderijdieren.